Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA3Q9Y6Q9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms