Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC3Q9Y6N6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC3Q9Y6N6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC3Q9Y6N6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC3Q9Y6N6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC3Q9Y6N6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC3Q9Y6N6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC3Q9Y6N6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC3Q9Y6N6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LAMC3Q9Y6N6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LAMC3Q9Y6N6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LAMC3Q9Y6N6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LAMC3Q9Y6N6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LAMC3Q9Y6N6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LAMC3Q9Y6N6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
LAMC3Q9Y6N6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
LAMC3Q9Y6N6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
LAMC3Q9Y6N6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
LAMC3Q9Y6N6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LAMC3Q9Y6N6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LAMC3Q9Y6N6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LAMC3Q9Y6N6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms