Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms