Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSPB11Q9Y547 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms