Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4BQ9Y4P1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4BQ9Y4P1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG4BQ9Y4P1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms