Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN3Q9Y4C0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms