Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFE2L3Q9Y4A8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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