Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF3AQ9Y496 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms