Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GINS2Q9Y248 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GINS2Q9Y248 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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