Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAK1Q9UPV9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms