Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms