Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms