Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUF60Q9UHX1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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