Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PEF1Q9UBV8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms