Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLKQ9UBT6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms