Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL9Q9P2J3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms