Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GDE1Q9NZC3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GDE1Q9NZC3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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