Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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