Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL28Q9NXS3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL28Q9NXS3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms