Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPTLC3Q9NUV7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTLC3Q9NUV7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms