Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A2Q9NTI2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A2Q9NTI2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms