Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms