Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER2Q9NSB8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER2Q9NSB8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms