Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT84Q9NSB2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms