Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms