Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.088e-9■■■■■ 196.3
UTP3Q9NQZ2 PIGS-214ENST00000584080 584 ntTSL 413.47□□□□□ -0.258e-9■■■■■ 196.3
UTP3Q9NQZ2 PIGS-201ENST00000268758 2397 ntTSL 213.02□□□□□ -0.328e-9■■■■■ 196.3
UTP3Q9NQZ2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.416e-7■■■■■ 196.2
UTP3Q9NQZ2 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.367e-7■■■■■ 196.1
UTP3Q9NQZ2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 196.1
UTP3Q9NQZ2 PRAF2-203ENST00000618882 439 ntTSL 57.98□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 196.1
UTP3Q9NQZ2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.817e-7■■■■■ 196.1
UTP3Q9NQZ2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.352e-7■■■■■ 196
UTP3Q9NQZ2 MAP4-216ENST00000633710 570 ntTSL 56.78□□□□□ -1.323e-8■■■■■ 195.9
UTP3Q9NQZ2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 195.9
UTP3Q9NQZ2 UNKL-212ENST00000511095 924 ntTSL 420.41■□□□□ 0.867e-10■■■■■ 195.8
UTP3Q9NQZ2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.451e-6■■■■■ 195.7
UTP3Q9NQZ2 POLR3H-208ENST00000442616 553 ntTSL 526■■□□□ 1.752e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 POLR3H-205ENST00000420561 517 ntTSL 425.36■■□□□ 1.652e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.227e-30■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 P3H1-210ENST00000463465 897 ntTSL 322.55■■□□□ 1.22e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 RNPS1-212ENST00000564822 314 ntTSL 422.07■■□□□ 1.121e-25■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.834e-8■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 DOLPP1-201ENST00000327812 1932 ntTSL 1 (best)19.88■□□□□ 0.774e-8■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.662e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 POLR3H-209ENST00000483837 1829 ntTSL 519.02■□□□□ 0.642e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.612e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 FCHSD1-207ENST00000522386 581 ntTSL 218.48■□□□□ 0.554e-9■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.524e-8■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 UEVLD-207ENST00000535340 724 ntTSL 217.76■□□□□ 0.434e-9■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 LSM14A-204ENST00000585887 445 ntTSL 217.73■□□□□ 0.437e-30■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 FCHSD1-208ENST00000522763 443 ntTSL 217.6■□□□□ 0.414e-9■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.394e-9■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 NADSYN1-214ENST00000529120 574 ntTSL 517.33■□□□□ 0.362e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 DDX56-210ENST00000479440 599 ntTSL 217.05■□□□□ 0.322e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 MFSD12-212ENST00000591878 557 ntTSL 517.03■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 MFSD12-205ENST00000585814 1002 ntTSL 316.82■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 NADSYN1-203ENST00000524949 839 ntTSL 216.48■□□□□ 0.232e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.222e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 UEVLD-211ENST00000540917 551 ntTSL 416.39■□□□□ 0.214e-9■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.214e-9■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 DDX56-202ENST00000415758 1287 ntTSL 516.27■□□□□ 0.22e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 UEVLD-206ENST00000490736 556 ntTSL 516.17■□□□□ 0.184e-9■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.164e-9■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 PASK-214ENST00000493544 5174 ntTSL 1 (best)15.8■□□□□ 0.122e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 RNF157-203ENST00000589317 568 ntTSL 215.77■□□□□ 0.122e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.092e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 NADSYN1-221ENST00000533769 559 ntTSL 415.41■□□□□ 0.062e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.037e-30■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 UEVLD-204ENST00000396196 1354 ntTSL 215.16■□□□□ 0.024e-9■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -07e-30■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 MFSD12-213ENST00000592652 486 ntTSL 514.69□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 SLC30A9-205ENST00000513699 2217 ntTSL 214.43□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.132e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 UEVLD-213ENST00000543987 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.154e-9■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 DDX56-206ENST00000446987 1853 ntTSL 514.09□□□□□ -0.152e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 DDX56-204ENST00000431640 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.212e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 KIF3C-205ENST00000475453 730 ntTSL 213.11□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.332e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 SLC30A9-201ENST00000264451 6218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 SLC4A1-202ENST00000399246 3855 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.392e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 DDX56-203ENST00000421223 3028 ntTSL 212.06□□□□□ -0.482e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF92-205ENST00000488849 582 ntTSL 412.04□□□□□ -0.482e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 AL591895.1-201ENST00000424332 348 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.562e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 SRRT-205ENST00000449389 448 ntTSL 311.42□□□□□ -0.587e-30■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 LSM14A-206ENST00000588582 3601 ntTSL 211.4□□□□□ -0.597e-30■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.62e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP1-203ENST00000525488 890 ntTSL 511.31□□□□□ -0.62e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 DDX56-212ENST00000485367 1781 ntTSL 511.26□□□□□ -0.612e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 FMNL1-208ENST00000589911 769 ntTSL 310.92□□□□□ -0.662e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.692e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP1-206ENST00000528837 1000 ntTSL 510.34□□□□□ -0.752e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF92-202ENST00000357512 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.882e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 RNF157-205ENST00000591355 559 ntTSL 49.46□□□□□ -0.92e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 HEATR6-201ENST00000184956 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.932e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP1-201ENST00000311956 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.952e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 UEVLD-210ENST00000540666 1830 ntTSL 28.92□□□□□ -0.984e-9■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 UEVLD-205ENST00000396197 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.134e-9■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 ASPH-228ENST00000523927 556 ntTSL 47.8□□□□□ -1.167e-8■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.264e-9■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.262e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 ZCCHC11-203ENST00000371541 4319 ntTSL 26.93□□□□□ -1.32e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 FMNL1-204ENST00000586092 453 ntTSL 26.69□□□□□ -1.342e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.422e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.762e-10■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 195.6
UTP3Q9NQZ2 SPTBN2-202ENST00000527010 859 ntTSL 216.41■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 195.5
UTP3Q9NQZ2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.566e-7■■■■■ 195.4
UTP3Q9NQZ2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 195.4
UTP3Q9NQZ2 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 195.4
UTP3Q9NQZ2 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 195.4
UTP3Q9NQZ2 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 195.4
UTP3Q9NQZ2 AKT2-208ENST00000416994 904 ntTSL 419.43■□□□□ 0.75e-7■■■■■ 195.4
UTP3Q9NQZ2 AKT2-227ENST00000498350 562 ntTSL 416.03■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 195.4
UTP3Q9NQZ2 SIK3-211ENST00000485363 764 ntTSL 1 (best)16.84■□□□□ 0.299e-7■■■■■ 195.4
UTP3Q9NQZ2 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 195.3
UTP3Q9NQZ2 LRRC75A-AS1-203ENST00000472367 794 ntTSL 319.23■□□□□ 0.678e-7■■■■■ 195.2
UTP3Q9NQZ2 LRRC75A-AS1-212ENST00000483588 688 ntTSL 318.48■□□□□ 0.558e-7■■■■■ 195.2
UTP3Q9NQZ2 LRRC75A-AS1-207ENST00000478103 712 ntTSL 311.02□□□□□ -0.658e-7■■■■■ 195.2
UTP3Q9NQZ2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 195.2
UTP3Q9NQZ2 ATG2A-202ENST00000418259 5654 ntTSL 517.66■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 195.2
UTP3Q9NQZ2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 195.2
UTP3Q9NQZ2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.123e-10■■■■■ 195.2
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 784.9 ms