Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INCENPQ9NQS7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INCENPQ9NQS7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INCENPQ9NQS7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
INCENPQ9NQS7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
INCENPQ9NQS7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
INCENPQ9NQS7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
INCENPQ9NQS7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
INCENPQ9NQS7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
INCENPQ9NQS7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INCENPQ9NQS7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INCENPQ9NQS7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INCENPQ9NQS7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INCENPQ9NQS7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INCENPQ9NQS7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms