Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms