Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRDE2Q9H7Z3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms