Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
C11orf49Q9H6J7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms