Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP62CLQ9H1M0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP62CLQ9H1M0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms