Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIL1Q9H173 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIL1Q9H173 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms