Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC8Q9H0W5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC8Q9H0W5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC8Q9H0W5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC8Q9H0W5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC8Q9H0W5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC8Q9H0W5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC8Q9H0W5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC8Q9H0W5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC8Q9H0W5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC8Q9H0W5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC8Q9H0W5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms