Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CTDSP1Q9GZU7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CTDSP1Q9GZU7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CTDSP1Q9GZU7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CTDSP1Q9GZU7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CTDSP1Q9GZU7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CTDSP1Q9GZU7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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