Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA4CQ9C0C4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4CQ9C0C4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms