Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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