Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms