Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CECR2Q9BXF3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CECR2Q9BXF3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms