Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VN1R3Q9BXE9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VN1R3Q9BXE9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms