Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC94Q9BW85 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC94Q9BW85 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms