Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms