Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPIFA3Q9BQP9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms