Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms