Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP9Q99956 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP9Q99956 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP9Q99956 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP9Q99956 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP9Q99956 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP9Q99956 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP9Q99956 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP9Q99956 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms