Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
PIK3R4Q99570 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIK3R4Q99570 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms