Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDK5RAP2Q96SN8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP2Q96SN8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms