Protein–RNA interactions for Protein: Q96S21

RAB40C, Ras-related protein Rab-40C, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40CQ96S21 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40CQ96S21 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB40CQ96S21 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms