Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARXQ96QS3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms