Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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