Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC7Q96NW7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC7Q96NW7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC7Q96NW7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC7Q96NW7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC7Q96NW7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC7Q96NW7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC7Q96NW7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC7Q96NW7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC7Q96NW7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC7Q96NW7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC7Q96NW7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC7Q96NW7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC7Q96NW7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC7Q96NW7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC7Q96NW7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms